代谢组学数据库,生物信息学的重要东西

1. HMDB（Human Metabolome Database）： 专心于人类代谢组，供给了关于小分子代谢物的具体化学、生物化学和生理数据。 包含代谢物的化学结构、生物途径、疾病相关、药物反响、基因表达数据以及质谱和核磁共振光谱数据。 数据能够免费拜访，而且定时更新。

2. METLIN： 由The Scripps Institute Gary Siuzdak组创建，首要用于非靶向代谢组学代谢产品判定。 具有很多的代谢产品MS/MS图谱，每个化合物都有不同的磕碰能图谱，能够明晰地找到代谢产品的碎片离子。 首要缺点是没有代谢产品在生物体中的浓度、代谢通路等信息，偏重于化学剖析。

3. MssBank： 用于存储和同享代谢组学试验中的质谱数据。 经过与数据库中一二级代谢产品的谱图信息进行比对，协助判定代谢物。

4. KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）： 由日本京都大学创建，是世界上最大、最全的生物信息学数据库之一。 供给了关于基因、基因组、蛋白质、RNA、化学物质、药物、疾病等信息，以及这些信息之间的相互效果和联系。

5. SMPDB（Small Molecule Pathway Database）： 存储小分子代谢途径的信息，展现了小分子在生物体内的代谢进程和相互效果。

这些数据库在代谢组学研讨中扮演着重要人物，供给了丰厚的代谢物和代谢途径信息，协助科研人员更好地了解和剖析代谢组学数据。

代谢组学数据库：生物信息学的重要东西

跟着生物信息学技能的飞速开展，代谢组学作为一门研讨生物体内一切代谢物组成和改变的科学，已经成为生命科学范畴的一个重要分支。代谢组学数据库作为存储、办理和剖析代谢组学数据的渠道，关于推进代谢组学研讨的开展具有重要意义。

代谢组学数据库的分类

代谢组学数据库首要分为两大类：原始数据库和代谢物库。

原始数据库：存储原始检测数据，如质谱数据、核磁共振数据等。这类数据库一般需求专业的生物信息学常识和软件进行数据解读。

代谢物库：存储代谢物及代谢通路相关信息，如代谢物的化学结构、分子量、代谢途径等。这类数据库便于用户进行代谢物判定、代谢通路剖析等。

代谢组学数据库的代表

Human Metabolome Database (HMDB)：包含人类代谢产品信息的归纳数据库，供给翔实的代谢产品描绘和相关数据。

Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)：广泛使用的代谢通路数据库，供给多种生物体的代谢组学数据和通路信息。

MetaboLights：EMBL-EBI的敞开拜访代谢组学数据库，包含很多的代谢组学数据以及相应的元数据和剖析成果。

Metabolite Link (Metlin)：一个用于判定已知和不知道代谢物及其他化学实体的技能渠道。

The Golm Metabolome Database (GMD)：一个体系整合和展现小分子代谢通路信息的数据库。

代谢组学数据库的使用

代谢组学数据库在多个范畴具有广泛的使用，首要包含：

疾病研讨：经过剖析疾病患者的代谢组数据，提醒疾病的产生机制，为疾病诊断和医治供给新的思路。

药物研制：使用代谢组学数据库进行药物挑选和效果机制研讨，加快新药研制进程。

食物科学：剖析食物中的代谢物，评价食物安全和营养价值。

环境科学：研讨环境污染物对生物体的代谢影响，为环境保护供给根据。

代谢组学数据库的开展趋势

跟着代谢组学技能的不断进步，代谢组学数据库的开展趋势首要体现在以下几个方面：

数据整合：将不同来历、不同类型的代谢组学数据整合到一个数据库中，进步数据使用功率。

智能化剖析：使用人工智能技能，完成代谢组学数据的主动剖析、猜测和解说。

敞开同享：推进代谢组学数据库的敞开同享，促进学术交流和协作。

代谢组学数据库作为生物信息学的重要东西，在代谢组学研讨、疾病诊断、药物研制等范畴发挥着重要效果。跟着技能的不断开展，代谢组学数据库将愈加完善，为生命科学范畴的研讨供给有力支撑。